基于ISSR的油茶品种遗传变异及亲缘关系研究

油茶(Camellia spp。)是我国南方特有的木本食用油料树种,然而,油茶品种的同物异名和同名异物现象对品种分类造成了困扰,对油茶育种和生产造成了巨大损失。本研究基于ISSR标记对来自安徽、江西、湖南、湖北、浙江和广西共 6 个原产地的共 90 个油茶品种(优良单株)的遗传变异和亲缘关系进行了研究,研究结果为油茶品种分类、鉴定、种质资源保护利用策略提供可靠的理论依据和实践指导。采用天根(TIANGEN)植物基因组DNA 提取试剂盒和细胞破碎仪(TissueLyser II,德国)提取油茶品种的叶片DNA.运用筛选出的 16 条ISSR有效引物进行ISSR-PCR实验分析。对全部应试油茶品种 PCR产物的琼脂糖凝胶电泳图谱进行判读,形成(0,1)二元式矩阵。运用软件POPGENE ver.1.32 计算各遗传多样性参数,即多态性位点数N、多态性位点百分率PPL、有效等位基因数ne、期望杂合度He、Shannon多态性信息指数I和品种间遗传相似度。运用软件NTSYS-pc ver.2.0,基于以原产地为组的品种间的Nei's遗传距离和非加权配对算数平均法(UPGMA,unweighted pairgroup method using arithmetic average)构建不同产地油茶品种聚类图。运用软件PAUP,基于Dice's遗传相似性系数和邻接法NJ(Neighbour-Joining)构建油茶品种聚类图。共检测出 410 个多态性位点,多态性位点百分率PPL = 100.00%,有效等位基因数ne = 1.330,期望杂合度He = 0.225,Shannon信息指数I = 0.368,油茶品种表现出较高的遗传多样性。以原产地为组的油茶品种组间Nei's遗传距离变动在 0.008(江西-浙江)-0.067(安徽-湖北)之间,平均遗传距离为 0.034,产地间遗传分化系数Gst = 0.133,基因流Nm = 3.258.基于邻接法NJ(Neighbour-Joining)的油茶品种聚类分析将 90 个油茶品种明显地区分开来,且大部分品种分组情况与产地基本一致,部分品种聚类情况没有规律。