樟树CcBADH基因的克隆与表达
本研究基于前期樟树转录组数据,筛选响应干旱胁迫的基因BADH,对该基因进行克隆与表达分析,命名为CcBADH.生物信息学分析表明,CcBADH基因长 1492 bp,编码 308 个氨基酸。与莲、澳洲坚果、蒂罗花、杧果的同源性达 75%以上,其中与莲的同源性最高(81%)。进化树将CcBADH与椰子、油棕、麻风树等聚为一类。预测CcBADH的氨基酸分子式为C1525H2439N405O427S13,分子量 33696.38,等电点 8.64,不稳定系数 33.44,表现为稳定的带正电的亲水性蛋白。定位在叶绿体基质,无信号肽。其二级结构包含 50.97%的 α-螺旋,14.29%的 β-折叠,6.49%β-转角和 28.25%无规则卷曲,三级结构呈椭球型,具有醛脱氢酶结构域,C末端含有一个跨膜结构域,猜测该结构域与蛋白质的运输机制有关。为检测CcBADH基因在干旱胁迫下的表达情况,对三个来自不同种源的樟树叶片进行荧光定量PCR实验,发现 CcBADH 在干旱胁迫下的表达量明显增加。研究结果为樟树的干旱生理机制研究奠定了基础,对抗旱樟树的种质创制和遗传改良有着重要意义。
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