转录组、sRNA及降解组测序分析表明 miRNA 调节 CMS棉花的花药发育
Integrated sequencing analysis of transcriptome, small RNA and degradome reveal that micro-RNAs regulate anther development in CMS cotton
细胞质雄性不育(CMS)是棉花杂种优势利用的重要表型性状,它的利用可以降低制种成本,提高制种纯度。miRNA在植物花粉发育中起着至关重要的作用。为了阐明miRNA-靶基因在棉花不育系ganmian15A及其保持系 ganmian15B中的作用,本研究对2个材料在花粉败育时期(3~4mm花蕾时期)的花药进行了转录组、sRNA及降解组测序。结果显示,ganmian15A与ganmian15B中共有339个已知的 miRNA和961个保守的miRNA,其中124个miRNA在2个材料间差异显著。通过多组学联合分析,鉴定了11对与花粉发育相关的 miRNA-靶基因。其中,9个miRNA(4个新的和5个已知的)首次被发现与棉花 CMS的发生有关。miRNA38和miRNA23的靶基因与花粉发育时期的细胞壁发育有关,它们可能通过延缓绒毡层细胞降解而在棉花的 CMS中发挥重要作用。该发现揭示了CMS发生的遗传调控新机理,这将有助于棉花新不育系的选育。
李永旗;聂太礼;张梦;张学贤;Kashif Shahzad;郭立平;戚廷香;唐会妮;王海林;乔秀琴;冯娟娟;吴建勇;邢朝柱;
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000##江西省经济作物研究所,江西九江332105;江西省经济作物研究所,江西九江332105;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室,河南安阳 455000;
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